有性杂交是选育马铃薯新品种的主要途径。19世纪初马铃薯育种主要是采取品种间杂交。自从发现马铃薯一些野生种和近缘栽培种具有价值的特性之后,到20世纪初,各国利用种间杂交相继选育出一些对主要病虫害(如晚疫病、病毒病、线虫等)具有综合抗性的新品种。在品种间杂交育种中所利用的亲本品种都是种间杂种,因而实际上也是种间杂交育种。
原产墨西哥的野生落果种S.demissum Lindl.和匍枝种S.stoloniferum Schlechtd.et Bche’,某些无性系有对晚疫病过敏型抗性和田间抗性。利用这些野生种与栽培品种杂交,育成了对晚疫病具有高度田间抗性的新品种,如格瑞他(Greta)、多利他(Dori-ta)等,其中多利他已成为欧洲和北美洲抗晚疫病育种中所采用的主要杂交亲本之一。匍枝种的一些无性系,具有对Y和A病毒免疫的显性基因,以这些无性系为亲本材料,已育成对Y和A病毒具有过敏型抗性的新品种格拉吉利亚(Grazilia)。
南美洲的四倍体栽培种安第斯亚种S.tuberosum ssp.andigena(Juz.et Buk.)Hawkes具有许多优良经济性状和特性(包括抗病、虫基因)。20世纪60年代末利用安第斯亚种与普通栽培种(即马铃薯亚种)杂交育成了许多抗病虫、高产的新品种。如荷兰、民主德国、联邦德国、英国和美国利用安第斯亚种为亲本育成了一些抗A生物型金线虫的品种阿米克司(Ameks)和尼米亚(Nemea)等。
原始的安第斯亚种为短日照型,*易与马铃薯亚种杂交。但F1多出现长匍匐枝、晚熟、块茎多而小的无性系,须多次回交。所谓新型栽培种(Neo-Tubero-sum),是原始的安第斯亚种(短日型),通过在长日照条件下进行轮回选择而育成的,是适应在长日照条件下结薯并具有安第斯亚种综合基因源的优良无性系。因此,利用新型栽培种与普通栽培种进行杂交便克服了直接利用安第斯亚种所遇到的困难。
新型栽培种与普通栽培种杂交,F1杂种具有显著的杂种优势,已为D.R.格林丁宁(Glendinning,1969)所证实。1980年以来,中国湖北、湖南、内蒙古和黑龙江等省(自治区)的一些科学研究单位,利用新型栽培种与普通栽培种杂交,育成了一些品种,多优于普通栽培种内杂交品种。